More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1492 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  99.66 
 
 		 298 aa  587  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  99.66 
 
 		 298 aa  587  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  96.98 
 
 		 298 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  96.64 
 
 		 298 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  94.63 
 
 		 298 aa  541  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  55.93 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  56.27 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  55.93 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  48.83 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  47.67 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.69 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  48.88 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  43.96 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  38.44 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 331 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  39.8 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1625  hypothetical protein  95.96 
 
 		 99 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  40.21 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  39.4 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 		 310 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  38.21 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  37.71 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  36.91 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  37.87 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  37.05 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  37.05 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  37.05 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1628  hypothetical protein  92.31 
 
 		 102 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  35.95 
 
 		 334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  37.17 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  43.68 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  34.02 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 		 475 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 329 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  40.6 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 		 267 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  47.15 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  40.25 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  43.26 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  42.25 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  33.01 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  39.62 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  45.61 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.3 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.3 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.3 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.3 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.3 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  41.61 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  41.61 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  41.61 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  49.12 
 
 		 290 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  41.61 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  41.61 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>