More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06040 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  78.32 
 
 		 309 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  78.64 
 
 		 311 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  77.1 
 
 		 310 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  78.32 
 
 		 311 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  68.95 
 
 		 317 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  65.8 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  68.51 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  62.42 
 
 		 298 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  57.61 
 
 		 310 aa  358  4e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  59.67 
 
 		 310 aa  352  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  58.69 
 
 		 313 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  53.44 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  53.44 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  53.44 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  54.1 
 
 		 309 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  53.77 
 
 		 309 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  55.52 
 
 		 312 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  58.7 
 
 		 316 aa  318  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  54 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  56.81 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  55.9 
 
 		 309 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  55.59 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  46.06 
 
 		 334 aa  251  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  43.69 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  43.69 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  43.67 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.99 
 
 		 307 aa  221  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  43.87 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  42.47 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  36.95 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  36.95 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  45.45 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1107  phosphatidate cytidylyltransferase  31.54 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  40.13 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.94 
 
 		 260 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  36.94 
 
 		 260 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  40.87 
 
 		 246 aa  96.3  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 264 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  39.83 
 
 		 265 aa  96.3  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  38.22 
 
 		 275 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  42.65 
 
 		 254 aa  95.9  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.92 
 
 		 267 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 		 242 aa  95.5  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  46.55 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 		 260 aa  93.2  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 280 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  41.94 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  41.94 
 
 		 285 aa  92.4  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 		 233 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  39.85 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  39.85 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  39.85 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  36.23 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  39.83 
 
 		 263 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  30.23 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 		 269 aa  89.4  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 		 241 aa  89  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.1 
 
 		 279 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  37.41 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.3 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  36.69 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  34.11 
 
 		 264 aa  88.2  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  38.3 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>