More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1174 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
310 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  58.2 
 
 
317 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  58.33 
 
 
331 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  60.73 
 
 
309 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  61.94 
 
 
311 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  61.94 
 
 
311 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  58.71 
 
 
310 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  57.61 
 
 
310 aa  358  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  57.57 
 
 
318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  58.92 
 
 
298 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  56.52 
 
 
310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  55.73 
 
 
313 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  50.34 
 
 
316 aa  301  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
309 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
309 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
309 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  49.66 
 
 
309 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  51.03 
 
 
309 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  49.32 
 
 
309 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  49.49 
 
 
309 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  53.1 
 
 
314 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  48.53 
 
 
312 aa  288  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  50.68 
 
 
309 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
309 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
309 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
309 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.02 
 
 
307 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.51 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  40.2 
 
 
318 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
329 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
313 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  39.56 
 
 
326 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  38.44 
 
 
298 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 
298 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  37.38 
 
 
324 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0557769 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  38.44 
 
 
298 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 
311 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  38.44 
 
 
298 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  38.44 
 
 
298 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  38.11 
 
 
298 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  38.11 
 
 
298 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  39.09 
 
 
298 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.14 
 
 
275 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  33.59 
 
 
262 aa  103  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 
287 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  33.54 
 
 
242 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
280 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.97 
 
 
475 aa  96.7  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.42 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  37.98 
 
 
211 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  38.02 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1107  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 
236 aa  93.2  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
265 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  38.71 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
282 aa  92.4  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
282 aa  92.4  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
282 aa  92.4  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.32 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  38.02 
 
 
282 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  33.14 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  37.21 
 
 
216 aa  90.1  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.84 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  38.02 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  38.02 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
285 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 
285 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.02 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  38.02 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.02 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  37.3 
 
 
249 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  37.31 
 
 
284 aa  89.7  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  42.28 
 
 
264 aa  89.7  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  35.62 
 
 
208 aa  89.4  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  30.51 
 
 
269 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 
205 aa  89  9e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  37.69 
 
 
284 aa  89  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.62 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  39.02 
 
 
233 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  38.33 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>