More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4517 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
309 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  97.09 
 
 
309 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  96.76 
 
 
309 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  96.76 
 
 
309 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  94.5 
 
 
309 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  94.17 
 
 
309 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  54 
 
 
310 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  53.16 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  53.4 
 
 
311 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  53.64 
 
 
310 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  53.4 
 
 
311 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  55.12 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  51.8 
 
 
317 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 
310 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  54.1 
 
 
318 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  52.15 
 
 
331 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  52.58 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  50.68 
 
 
310 aa  306  3e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 
298 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  55.02 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  52.32 
 
 
314 aa  299  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  47.8 
 
 
316 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  44.3 
 
 
312 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
334 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 
318 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  39.09 
 
 
329 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 
313 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  39.57 
 
 
326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
309 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
309 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
309 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  38.54 
 
 
324 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  38.13 
 
 
311 aa  178  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  36.39 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  36.39 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  36.39 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 
298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  36.07 
 
 
298 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  36.07 
 
 
298 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  35.55 
 
 
298 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  32.37 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
265 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
265 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
260 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  42.19 
 
 
263 aa  95.9  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
287 aa  95.9  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1107  phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 
236 aa  95.5  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  42.62 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  27.67 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  36.94 
 
 
259 aa  93.6  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 
263 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  40.6 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 
285 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  43.09 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  41.04 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  40.74 
 
 
249 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  40.43 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  41.54 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  35.76 
 
 
280 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.74 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
256 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
339 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  40.6 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 
283 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
280 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  42.86 
 
 
282 aa  89  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  34.32 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 
280 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0690  dihydroneopterin aldolase  33.71 
 
 
287 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000502165 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>