More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1275 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 309 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  99.68 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  95.15 
 
 		 309 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  94.82 
 
 		 309 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  94.82 
 
 		 309 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  94.17 
 
 		 309 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  53.77 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  53.18 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  53.33 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  52.1 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  52.43 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  54.79 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  51.8 
 
 		 317 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  52.48 
 
 		 331 aa  314  9e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  54.1 
 
 		 318 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  53.25 
 
 		 309 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  49.32 
 
 		 310 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  54.36 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  50.68 
 
 		 298 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  51.99 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  48.31 
 
 		 316 aa  265  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  43.56 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  40.66 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 309 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  38.21 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 		 311 aa  175  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  37.87 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  37.87 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  37.87 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  37.54 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  37.54 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  37.54 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  37.88 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  37.88 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  34.55 
 
 		 259 aa  93.6  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  47.79 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 		 260 aa  92.4  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  41.8 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 233 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1107  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  31.46 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  33.83 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 		 263 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  42.86 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  38.73 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.17 
 
 		 475 aa  87.4  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  40.48 
 
 		 285 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  42.28 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  38.62 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 246 aa  86.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 260 aa  86.3  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0690  dihydroneopterin aldolase  32.57 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000502165 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  36.67 
 
 		 264 aa  85.9  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  26.88 
 
 		 275 aa  85.9  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  39.23 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  36.92 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  38.57 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  39.84 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  33.11 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  33.14 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  28.35 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  38.35 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.68 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  38.35 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  37.3 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  38.35 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>