More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3655 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 331 aa  656    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  67.73 
 
 		 317 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  68.06 
 
 		 311 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  67.74 
 
 		 311 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  65.26 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  65.8 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  65.48 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  65.58 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  58.33 
 
 		 310 aa  376  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  60.14 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  57.14 
 
 		 310 aa  358  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  54.63 
 
 		 313 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  58.02 
 
 		 316 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  52.81 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  52.81 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  53.38 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  52.81 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  52.81 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  52.48 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  52.15 
 
 		 309 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  51.14 
 
 		 312 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  52.28 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  50.32 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  42.81 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  42.07 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  42.07 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  41.75 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  41.85 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.23 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  41.9 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  39.63 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  40.6 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  39.26 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  39.26 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  44.81 
 
 		 311 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 		 262 aa  99.8  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.15 
 
 		 285 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  39.29 
 
 		 249 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  30.1 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  39.29 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  36.71 
 
 		 252 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  39.16 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 233 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 280 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  39.44 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  39.44 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.08 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  39.44 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  28.35 
 
 		 260 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  28.35 
 
 		 260 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 256 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.08 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  37.25 
 
 		 285 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 275 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  42.15 
 
 		 264 aa  90.1  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 		 254 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  27.94 
 
 		 265 aa  89.4  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 260 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  34.36 
 
 		 275 aa  89.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.37 
 
 		 260 aa  89.4  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  39.49 
 
 		 282 aa  89  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 242 aa  89  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  29.48 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  36.18 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  39.85 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  42.52 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  38.03 
 
 		 264 aa  86.7  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 269 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 		 280 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 		 293 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 		 261 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>