More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5541 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  85.16 
 
 		 311 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  84.52 
 
 		 311 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  80.65 
 
 		 310 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  78.32 
 
 		 310 aa  484  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  70.32 
 
 		 317 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  65.26 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  66.99 
 
 		 318 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  61.36 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  60.73 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  60.47 
 
 		 298 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  56.59 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  55.66 
 
 		 314 aa  329  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  53.51 
 
 		 309 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  53.18 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  53.16 
 
 		 309 aa  315  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  55.86 
 
 		 316 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  55.52 
 
 		 309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  54.88 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  51.3 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  43.96 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  43.99 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  43.99 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  45.83 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.66 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  38.98 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  42.29 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  39.66 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  39.66 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  37.84 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  43.97 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  31.05 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  31.05 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  39.42 
 
 		 283 aa  97.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  28.95 
 
 		 275 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  36.31 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  30.17 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 		 242 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  42.62 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  37.84 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1107  phosphatidate cytidylyltransferase  33.16 
 
 		 236 aa  94  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  40.56 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 		 269 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  42.02 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  40.32 
 
 		 241 aa  92.8  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  42.98 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 		 254 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  38.35 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 		 285 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 		 285 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 		 285 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  38.41 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 		 285 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 		 285 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 233 aa  89.7  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.14 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  28.87 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  37.98 
 
 		 279 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>