More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2935 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 312 aa  618  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  55.52 
 
 		 310 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  51.64 
 
 		 317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  52.24 
 
 		 310 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  52.13 
 
 		 318 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  51.3 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  51.02 
 
 		 298 aa  295  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  51.14 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  51.82 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  51.49 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  48.53 
 
 		 310 aa  288  9e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  52.68 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  51.02 
 
 		 310 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  48.83 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  51.84 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  45.3 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  47.6 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  43.56 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  44.3 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  41.51 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  39.19 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  38.98 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  38.98 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  39.27 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  40.33 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  42.69 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  39.32 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  39 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  39 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  39 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  39 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  30.22 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 		 269 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  39.68 
 
 		 280 aa  99.4  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 		 280 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  39.86 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  36.97 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  42.57 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 246 aa  92.4  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 		 211 aa  92.4  8e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  36.97 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 		 285 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  38.98 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  29.86 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  39.5 
 
 		 322 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.66 
 
 		 475 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  35.15 
 
 		 216 aa  90.5  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  34.11 
 
 		 253 aa  90.1  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.55 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  37.7 
 
 		 284 aa  89.7  6e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  27.44 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  43.81 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  40.91 
 
 		 282 aa  89  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  40.87 
 
 		 279 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  43.7 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  41.29 
 
 		 271 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  37.72 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  41.29 
 
 		 271 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  38.13 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  43.7 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  43.7 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  48.57 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 264 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  38.19 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 		 205 aa  87.8  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  36.75 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  36.75 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  35.5 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 		 241 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>