More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1107 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1107  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
236 aa  456  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  41.47 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 
264 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
263 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
336 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 
263 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  37.24 
 
 
269 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
264 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
267 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
262 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
280 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  37.27 
 
 
272 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  34.32 
 
 
276 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  35.86 
 
 
269 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  43.85 
 
 
264 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  31.42 
 
 
258 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 
271 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
273 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.14 
 
 
271 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  48.21 
 
 
266 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  31.28 
 
 
275 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
270 aa  99.8  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  30.23 
 
 
280 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
260 aa  99.4  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  45.05 
 
 
261 aa  99  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  34.74 
 
 
268 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.54 
 
 
310 aa  98.6  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.08 
 
 
272 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
267 aa  98.6  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 
280 aa  98.6  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  40.58 
 
 
285 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  36.08 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  39.37 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  37.8 
 
 
267 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  41.74 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  31.28 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  38.2 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  38.2 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  41.6 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
475 aa  95.9  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.07 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
208 aa  95.9  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  38.2 
 
 
263 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  38.2 
 
 
263 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
260 aa  95.5  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
282 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 
271 aa  95.5  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  42.19 
 
 
276 aa  95.5  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  35.84 
 
 
275 aa  95.5  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  34.54 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 
309 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  41.67 
 
 
280 aa  95.1  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  38.2 
 
 
265 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  38.2 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  35.52 
 
 
275 aa  95.1  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 
242 aa  95.1  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 
309 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 
309 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
285 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
271 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 
309 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  33.16 
 
 
309 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 
307 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  36.6 
 
 
280 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  30.4 
 
 
269 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 
310 aa  93.2  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  45.9 
 
 
282 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  37.6 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
283 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  31.46 
 
 
285 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 
310 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  40.48 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  36.72 
 
 
282 aa  92  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  42.99 
 
 
272 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 
283 aa  92  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  36.72 
 
 
282 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  36.72 
 
 
282 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 
261 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 
279 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
309 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  41.44 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 
287 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 
281 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  37.4 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 
285 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>