More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0517 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
272 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  45.77 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  45.61 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  41.28 
 
 
264 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 
269 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  39.11 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  46.45 
 
 
275 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.86 
 
 
475 aa  122  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  32 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  33.96 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  35.5 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.01 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  52.73 
 
 
260 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  44.57 
 
 
233 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  43.4 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  32.23 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.03 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  33.86 
 
 
339 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.37 
 
 
282 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  30.37 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  30.37 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  30.37 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  30.37 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  49.54 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  32.22 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  34.39 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.73 
 
 
236 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  38 
 
 
368 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  53.08 
 
 
268 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
276 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  36.21 
 
 
255 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  38.59 
 
 
296 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
246 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 
267 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  47.18 
 
 
271 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 
264 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  36.16 
 
 
268 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  32.45 
 
 
264 aa  106  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
262 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  30.71 
 
 
264 aa  106  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.52 
 
 
260 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  36.52 
 
 
260 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  36.93 
 
 
263 aa  105  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
307 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  35.12 
 
 
260 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  48.65 
 
 
254 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
278 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 
261 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  46.97 
 
 
273 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
266 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  30.83 
 
 
259 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  33.01 
 
 
296 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 
290 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
275 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  36.26 
 
 
343 aa  101  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
269 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  40.51 
 
 
262 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  37.37 
 
 
348 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 
258 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  43.85 
 
 
269 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  30.8 
 
 
269 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
319 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  47.22 
 
 
280 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
280 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
253 aa  100  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  30.71 
 
 
277 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
287 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  40.8 
 
 
265 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
284 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 
211 aa  100  4e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 
264 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 
289 aa  99.8  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  46.96 
 
 
328 aa  99.4  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 
281 aa  99.4  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
208 aa  99.4  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 
279 aa  99  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 
295 aa  98.6  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
341 aa  98.2  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  51.26 
 
 
280 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  42.37 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  42.37 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  30.77 
 
 
216 aa  97.8  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>