More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1613 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
280 aa  560  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  39.4 
 
 
296 aa  188  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  36.9 
 
 
246 aa  168  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  36.03 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  35.13 
 
 
269 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  32.75 
 
 
277 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 
263 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 
280 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  32.14 
 
 
284 aa  122  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  48.44 
 
 
295 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  35.66 
 
 
712 aa  122  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  53.1 
 
 
260 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
281 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  53.1 
 
 
260 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  52.59 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  49.17 
 
 
281 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
285 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.17 
 
 
281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  53.45 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  49.17 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  51.67 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  54.1 
 
 
242 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  49.26 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  33.6 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  55.86 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  55.86 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  53.39 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  49.31 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  55.86 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  36.5 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  55.86 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  43.23 
 
 
282 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.53 
 
 
341 aa  117  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  50.43 
 
 
285 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  43.23 
 
 
282 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  43.23 
 
 
282 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  52.17 
 
 
285 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  41.07 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.38 
 
 
285 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 
260 aa  116  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  48.53 
 
 
265 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  51.3 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.3 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  32.36 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  48.28 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  30.7 
 
 
307 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  50.86 
 
 
285 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  30.32 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  46.88 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  50.86 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  50.86 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
270 aa  112  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  42.36 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.36 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  42.36 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  42.36 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  42.36 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  42.36 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  52.25 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  42.36 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  42.36 
 
 
249 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  50.86 
 
 
254 aa  112  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  43.06 
 
 
285 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  32.03 
 
 
263 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  43.06 
 
 
285 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.06 
 
 
285 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  43.06 
 
 
285 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  32.38 
 
 
263 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.06 
 
 
285 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  32.03 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  49.56 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  49.19 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  50.86 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  32.03 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  28.72 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  42.36 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  35.42 
 
 
285 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  44.38 
 
 
290 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  46.46 
 
 
310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  45.3 
 
 
287 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
261 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
256 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  32.27 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  47.45 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  32.27 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  32.27 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  32.27 
 
 
263 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 
306 aa  108  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 
280 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
264 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  42.65 
 
 
264 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
274 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>