More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1726 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 313 aa  622  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  59.27 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  53.72 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  53.72 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  53.4 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  51.79 
 
 		 307 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  54.96 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  51.47 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  45.64 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  48.83 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  49.16 
 
 		 298 aa  261  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  48.83 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  48.83 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  48.83 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  48.83 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  48.83 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  48.49 
 
 		 298 aa  255  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  44.95 
 
 		 318 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  45.7 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  43.96 
 
 		 309 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  42.81 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.55 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.22 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 		 309 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  39.19 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  34.96 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  31.65 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  32.48 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  32.67 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  48.41 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  46.4 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  47.06 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  46.4 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.26 
 
 		 266 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  39.07 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  51.22 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  42.54 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.59 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  49.57 
 
 		 290 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  36.16 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  46.83 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  46.83 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  46.83 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 		 211 aa  105  9e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.6 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  35.5 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  50.43 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  50.43 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  49.57 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  34.69 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  35.34 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.1 
 
 		 280 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 		 285 aa  99  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  39.55 
 
 		 285 aa  99  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  36.78 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>