64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0483 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 324 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  58.26 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  61.18 
 
 		 326 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  58.15 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  42.72 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.87 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  41.9 
 
 		 331 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  39.94 
 
 		 318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.06 
 
 		 311 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.06 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  41 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  42.36 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  37.38 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  38.87 
 
 		 309 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  38.87 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  38.54 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  38.87 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 		 313 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  39.94 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  38.21 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  40.33 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  38.41 
 
 		 309 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  33.11 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  31.31 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  33.99 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  33.99 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  33.66 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  28.85 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  31.12 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  35.18 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  34.68 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  28.38 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  31.48 
 
 		 280 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  30.23 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  24.46 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 		 280 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  27.07 
 
 		 287 aa  46.2  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  23.58 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  25.38 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  29.32 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  22.39 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  22.39 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  22.39 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  27.69 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  26.89 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  26.43 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  30.37 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  29.46 
 
 		 246 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  28.26 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  22.13 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>