More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4663 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 317 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  71.07 
 
 		 318 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  70.13 
 
 		 310 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  71.7 
 
 		 311 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  71.38 
 
 		 311 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  70.32 
 
 		 309 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  67.73 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  68.95 
 
 		 310 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  65.77 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  58.2 
 
 		 310 aa  388  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  60 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  61.38 
 
 		 316 aa  362  4e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  56.44 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  58.02 
 
 		 314 aa  328  5.0000000000000004e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  52.79 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  52.79 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  52.79 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  52.13 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  51.64 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  51.8 
 
 		 309 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  54.49 
 
 		 309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  54.11 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  51.8 
 
 		 309 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  48.11 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  43.81 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  43.81 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  43.49 
 
 		 309 aa  228  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  42.72 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.44 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  41.48 
 
 		 313 aa  215  9e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  39.26 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  39.26 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  37.82 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  50.88 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  36.94 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  31.76 
 
 		 265 aa  103  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  42.62 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.98 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  42.62 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  44.25 
 
 		 279 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 280 aa  96.3  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.5 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  45.3 
 
 		 264 aa  95.9  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  38.66 
 
 		 282 aa  95.9  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  38.66 
 
 		 282 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  38.66 
 
 		 282 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  40.34 
 
 		 282 aa  95.9  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.35 
 
 		 265 aa  95.9  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  39.5 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  38.35 
 
 		 265 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  37.84 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  39.5 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  33.61 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  39.5 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  36.97 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  43.59 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 285 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 		 284 aa  92.8  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 263 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  44.35 
 
 		 264 aa  92.4  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 208 aa  92  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  36.8 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 		 242 aa  92  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.05 
 
 		 368 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  38.21 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  31.09 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>