More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1590 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
298 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  96.98 
 
 
298 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  96.98 
 
 
298 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  96.98 
 
 
298 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  96.64 
 
 
298 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  96.64 
 
 
298 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  94.97 
 
 
298 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  94.3 
 
 
298 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  56.61 
 
 
309 aa  322  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  56.27 
 
 
309 aa  321  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  56.27 
 
 
309 aa  321  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  48.83 
 
 
313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
318 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.69 
 
 
307 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  48.88 
 
 
313 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 
310 aa  205  9e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  44.32 
 
 
311 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  40.6 
 
 
331 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  41 
 
 
317 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  39.8 
 
 
310 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1625  hypothetical protein  95.96 
 
 
99 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 
309 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 
313 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 
309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
310 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  39.14 
 
 
309 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 
298 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.73 
 
 
311 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
312 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.73 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  37.25 
 
 
318 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  37.87 
 
 
310 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  37.54 
 
 
309 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
309 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
309 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
314 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  37.88 
 
 
316 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 
309 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1628  hypothetical protein  95.6 
 
 
102 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  37.92 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  35.95 
 
 
334 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  42.68 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  51.59 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  31.03 
 
 
326 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
211 aa  114  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.76 
 
 
475 aa  112  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
233 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  40.6 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  40.88 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 
267 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 
267 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  47.97 
 
 
264 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 
296 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
283 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  44.7 
 
 
282 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
252 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
267 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 
260 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
260 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
262 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  39.62 
 
 
285 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 
254 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
242 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 
278 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
264 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 
265 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 
266 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
285 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 
280 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
290 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
285 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
285 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
261 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
265 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 
273 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 
275 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  42.65 
 
 
285 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  41.91 
 
 
249 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  32.52 
 
 
306 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 
282 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 
285 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  102  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
285 aa  102  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>