24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1625 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1625  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  194  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  95.96 
 
 		 298 aa  190  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  95.96 
 
 		 298 aa  190  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  95.96 
 
 		 298 aa  190  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  95.96 
 
 		 298 aa  190  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  95.96 
 
 		 298 aa  190  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  95.96 
 
 		 298 aa  190  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  94.95 
 
 		 298 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  93.94 
 
 		 298 aa  186  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 309 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 		 309 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 		 309 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  36.63 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 307 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 		 318 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 		 312 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  35.35 
 
 		 313 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  35.62 
 
 		 313 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  32.35 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  32.35 
 
 		 309 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  30.19 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  31.68 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  30.19 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  30.19 
 
 		 309 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>