More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1763 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  96.31 
 
 		 298 aa  547  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  96.64 
 
 		 298 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  96.31 
 
 		 298 aa  547  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  96.64 
 
 		 298 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  96.64 
 
 		 298 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  94.3 
 
 		 298 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  93.62 
 
 		 298 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  55.25 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  55.25 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  55.59 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  48.49 
 
 		 313 aa  266  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  47 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.34 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  49.08 
 
 		 313 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  39.09 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1625  hypothetical protein  93.94 
 
 		 99 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  39.73 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.72 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.72 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  36.58 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  37.71 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  38.21 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  36.21 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  36.21 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  36.21 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  37.4 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1628  hypothetical protein  93.41 
 
 		 102 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  37.13 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  32.91 
 
 		 334 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  44.79 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 		 211 aa  114  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  40.6 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.76 
 
 		 475 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  45.8 
 
 		 262 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  45.53 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.42 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  42.42 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  35.35 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  39.05 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  43.08 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  41.84 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.43 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  30.45 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  39.57 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  45.59 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  42.31 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  32.04 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  36.48 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  33.1 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.54 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  36.2 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  39.79 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  48.28 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  35.97 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  45.61 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>