34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1628 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1628  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  199  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  95.6 
 
 		 298 aa  153  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  93.41 
 
 		 298 aa  149  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  92.31 
 
 		 298 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  92.31 
 
 		 298 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  92.31 
 
 		 298 aa  148  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  92.31 
 
 		 298 aa  147  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  92.31 
 
 		 298 aa  147  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  89.01 
 
 		 298 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  51.11 
 
 		 309 aa  90.1  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 309 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 309 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  43.01 
 
 		 313 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  43.82 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  42.53 
 
 		 313 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  35.48 
 
 		 311 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 		 313 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  36.26 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  34.88 
 
 		 310 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  34.69 
 
 		 316 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 331 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 		 317 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  36.17 
 
 		 309 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 		 312 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  36.26 
 
 		 309 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  31.4 
 
 		 318 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  32.26 
 
 		 314 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  33.8 
 
 		 324 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 		 310 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 		 311 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>