More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6184 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 309 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  95.13 
 
 		 309 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  56.39 
 
 		 313 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  55.56 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  56.66 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  56.39 
 
 		 311 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  56.07 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  53.62 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  53.11 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  57.29 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  54.52 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  52.58 
 
 		 309 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  52.58 
 
 		 309 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  52.58 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  53.25 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  52.92 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  53.44 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  51.18 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  56.04 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  50.16 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  53.23 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  49.32 
 
 		 316 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  45.87 
 
 		 312 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  41.97 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  40.92 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  40.92 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  40.92 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.39 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  41.45 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 329 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  38.7 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  40.36 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  39.07 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 311 aa  189  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  39.4 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  39.4 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  38.54 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  34.1 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  42.15 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  39.23 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  39.23 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  39.23 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 		 475 aa  96.3  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  40.97 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  37.69 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  40.32 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.69 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.69 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  41.94 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  31.3 
 
 		 266 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 		 276 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  28.47 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  38.71 
 
 		 265 aa  89.7  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 		 287 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  26.64 
 
 		 275 aa  89.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  36.92 
 
 		 285 aa  89  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  37.8 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  38.84 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  35.14 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.53 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  38.66 
 
 		 280 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  40.68 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 		 242 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  35.66 
 
 		 260 aa  85.9  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  36.59 
 
 		 269 aa  85.9  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  35.66 
 
 		 260 aa  85.9  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  38.02 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 		 260 aa  85.5  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37.12 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  40.32 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  36.64 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>