More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1536 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
242 aa  474  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  59.75 
 
 
241 aa  271  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  59.75 
 
 
241 aa  271  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  60.08 
 
 
241 aa  269  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  41.77 
 
 
243 aa  209  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  40.42 
 
 
254 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  43.21 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0421  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 
243 aa  188  7e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
253 aa  175  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0125  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
251 aa  143  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.447274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
287 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  34.43 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  43.92 
 
 
256 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
285 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  42.96 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  32.61 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  32.61 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  32.61 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  41.76 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  36.46 
 
 
249 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 
475 aa  112  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  38.95 
 
 
285 aa  111  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  36.67 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 
275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.67 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.67 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 
287 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  36.67 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  36.67 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  38.73 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  48.15 
 
 
285 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  37.43 
 
 
285 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  42.97 
 
 
285 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  43.75 
 
 
285 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  48.6 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  47.22 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
269 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  37.31 
 
 
285 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  48.15 
 
 
285 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  48.06 
 
 
296 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.54 
 
 
264 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  38.69 
 
 
284 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
271 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
275 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
205 aa  106  3e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
271 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
271 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
285 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
285 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  35.42 
 
 
272 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  38.3 
 
 
269 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
270 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
319 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
268 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
294 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  47.37 
 
 
268 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  47.37 
 
 
272 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 
268 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  49.53 
 
 
255 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
271 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 
285 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 
271 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  48.6 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 
295 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
246 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  48.6 
 
 
263 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  48.6 
 
 
263 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
263 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  48.6 
 
 
263 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
265 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.1 
 
 
211 aa  102  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
221 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  49.54 
 
 
285 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
260 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
260 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  38.36 
 
 
280 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
285 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 
280 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 
285 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
273 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 
266 aa  101  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.21 
 
 
233 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>