More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0122 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
253 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  54.37 
 
 
247 aa  254  9e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  46.25 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0421  phosphatidate cytidylyltransferase  46.64 
 
 
243 aa  211  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  40.96 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
242 aa  175  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
241 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  40.49 
 
 
241 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
241 aa  158  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0125  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.447274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  53.98 
 
 
275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  54.95 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
263 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  32.35 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  35.69 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  48.7 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  33.86 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
205 aa  108  6e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  51.4 
 
 
285 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  47.83 
 
 
285 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  47.83 
 
 
285 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  41.48 
 
 
268 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  48.7 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
270 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
285 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
270 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  46.73 
 
 
285 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
296 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  47.93 
 
 
255 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  48.6 
 
 
285 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  48.7 
 
 
266 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
263 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
287 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
263 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
263 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  48.6 
 
 
285 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
285 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
270 aa  105  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
263 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
263 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
265 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
263 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  42.06 
 
 
285 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  41.84 
 
 
280 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  51.49 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  51.49 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  51.49 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 
285 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  46.3 
 
 
285 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  51.49 
 
 
290 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
273 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  45.79 
 
 
261 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  50.48 
 
 
295 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  50.48 
 
 
295 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  32.64 
 
 
282 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  45.61 
 
 
275 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.15 
 
 
288 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  32.64 
 
 
282 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  32.64 
 
 
282 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  44.17 
 
 
233 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
260 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  47.93 
 
 
260 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  47.93 
 
 
260 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
272 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  45.22 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.38 
 
 
282 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  33.5 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  49.15 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 
285 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  48.21 
 
 
285 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
295 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  45.45 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
285 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 
267 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  37.87 
 
 
211 aa  96.3  5e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>