More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0664 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 295 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.88 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  48.44 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  33.79 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  34.72 
 
 		 712 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  48.76 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  33.11 
 
 		 277 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  31.77 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  39.08 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  39.17 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.16 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  31.21 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  29.55 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  30.03 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.97 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  31.44 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  31.1 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  48.12 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  31.23 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  31.06 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  32.69 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  30.9 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  47.83 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.59 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  50.41 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  43.88 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  48.84 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  40.23 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 		 254 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  39.07 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  30.66 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  35.52 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  43.85 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  31.05 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  29.69 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  30.36 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 		 241 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  30.38 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 		 262 aa  99.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  35.03 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  36.31 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 		 272 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  49.17 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  39.39 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  29.19 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  39.39 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  39.39 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  32.46 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  29.39 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  32.46 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  32.46 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0119  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  32.46 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 		 475 aa  97.1  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  32.46 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  32.46 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  32.46 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  32.37 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>