More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2250 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0125  phosphatidate cytidylyltransferase  50.6 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.447274  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0421  phosphatidate cytidylyltransferase  47.48 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  40.42 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  40.96 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  43.15 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  50.85 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  49.15 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  32.93 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  51.26 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  44.37 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  34.66 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  47.32 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  38.99 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  32.94 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  30.62 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  30.62 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  48.39 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  48.44 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  48.28 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  29.46 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 		 328 aa  99.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  32.94 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  32.94 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 263 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 268 aa  98.6  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 293 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  49.56 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  35.45 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  40.44 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  39.42 
 
 		 282 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  41.3 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  30.94 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  39.42 
 
 		 282 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  34.36 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 287 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  39.86 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  39.42 
 
 		 282 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  40.29 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  50.48 
 
 		 290 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  48.67 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  40.41 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  48.57 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  47.15 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  40.85 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40.85 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  42.28 
 
 		 364 aa  95.5  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  40.14 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.85 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  40.14 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.85 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.85 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  40.14 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  40.14 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  29.64 
 
 		 307 aa  95.5  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  40.14 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>