More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0125 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0125  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 251 aa  484  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.447274  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  50.6 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  39.59 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  37.45 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0421  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  38.17 
 
 		 241 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  38.68 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  38.54 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 		 290 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  51.4 
 
 		 293 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  51.28 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  49.57 
 
 		 295 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  49.57 
 
 		 295 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  49.54 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  49.54 
 
 		 268 aa  98.6  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  37.43 
 
 		 275 aa  98.6  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 		 284 aa  98.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  31.43 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  31.43 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 285 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.1 
 
 		 205 aa  97.4  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 		 285 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  41.45 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  40.79 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  43.8 
 
 		 364 aa  96.3  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  39.29 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 275 aa  95.9  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  40 
 
 		 291 aa  95.5  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  36.81 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  50.5 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 293 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  42.36 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  50.5 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  34.38 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  37.28 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  50.5 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  46.36 
 
 		 288 aa  93.2  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  30.91 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  30.11 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 304 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  46.73 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  38.33 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 310 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  49.5 
 
 		 285 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  47.12 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.73 
 
 		 211 aa  92  8e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.66 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 		 280 aa  92  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 		 310 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  42.14 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  45.37 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  43.59 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.76 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.59 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  46.3 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.59 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  43.59 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  33.15 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  43.59 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.76 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40.6 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>