More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1623 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 288 aa  564  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  74.67 
 
 		 301 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  69.34 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  61.99 
 
 		 295 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  61.99 
 
 		 295 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  63.76 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  52.3 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  54.78 
 
 		 285 aa  291  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  53 
 
 		 285 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  53.36 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 		 290 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  45.33 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  45.88 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.88 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  44.55 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  42.07 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  47.33 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  30.51 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 		 267 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  31.7 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  35.5 
 
 		 264 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47250  predicted protein  31.1 
 
 		 574 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  37.4 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  31.88 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  32.09 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  30.71 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  39.68 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  42.01 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.14 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  30.92 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  39.89 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  39.89 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.88 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  34.8 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  42.99 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 253 aa  106  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  42.36 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  32.09 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  32.09 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  35.93 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  41.84 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  34.74 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.57 
 
 		 341 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  31.67 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  32.8 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.68 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  41.24 
 
 		 275 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  32.59 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  32.59 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  43.12 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  40.52 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  32.59 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0125  phosphatidate cytidylyltransferase  48.18 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.447274  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.83 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  37.84 
 
 		 282 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  32.47 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  39.55 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.1 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  38.86 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  50.91 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>