More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3431 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  83.33 
 
 
295 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  83.33 
 
 
295 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  66.01 
 
 
293 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  64.9 
 
 
290 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  67.32 
 
 
293 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  64.82 
 
 
332 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  63.88 
 
 
288 aa  342  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  47.68 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
295 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
295 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  46.71 
 
 
294 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  45.03 
 
 
301 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 
285 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  44.37 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  43.81 
 
 
285 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.32 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47250  predicted protein  36.96 
 
 
574 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110596  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  33.44 
 
 
364 aa  146  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.9 
 
 
280 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  33.44 
 
 
277 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  48.91 
 
 
262 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  42.38 
 
 
279 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  32.12 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  48.84 
 
 
273 aa  112  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  29.94 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
274 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  32.88 
 
 
281 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  50.41 
 
 
283 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  50.43 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  48.39 
 
 
263 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 
266 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  29.74 
 
 
271 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  30.03 
 
 
261 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 
306 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  49.57 
 
 
318 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  53.72 
 
 
261 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
286 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
246 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  29.33 
 
 
267 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  29 
 
 
264 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
252 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  27.65 
 
 
275 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  47.5 
 
 
280 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
285 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 
287 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
285 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  49.22 
 
 
271 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  47.46 
 
 
264 aa  102  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
263 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
282 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 
267 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 
273 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  47.41 
 
 
298 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
298 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
267 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
233 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  49.57 
 
 
271 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
298 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
298 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  47.41 
 
 
298 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
208 aa  100  4e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  55.17 
 
 
236 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
267 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
254 aa  99.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
298 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
282 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
282 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
282 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
256 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  49.12 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  44.63 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  46.34 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  48 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  51.43 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  48 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  48 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  48 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  44.63 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  45.69 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  48 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>