More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5907 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 281 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  65.93 
 
 		 293 aa  350  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  58.82 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  56.36 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  53.6 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  51.45 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  50 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  52.98 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  52.98 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  52.98 
 
 		 284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  51.8 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  51.59 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 		 276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  49.09 
 
 		 339 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.43 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  49.63 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  49.06 
 
 		 290 aa  208  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  44.69 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  45.09 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  48.15 
 
 		 441 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  50.74 
 
 		 484 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  45.8 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 		 352 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  41.73 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  45.04 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  44.89 
 
 		 287 aa  187  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  44.57 
 
 		 280 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  38.62 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.81 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  42.12 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  40.43 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  51.63 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  46.5 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  40.84 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  31.17 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  37.24 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  35.57 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.59 
 
 		 475 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  48.8 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  32.48 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.04 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  31.18 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  48.6 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  40.59 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  38.37 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  48.18 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  35.53 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  36.02 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  37.65 
 
 		 281 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  40.13 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  32.24 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.65 
 
 		 281 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  31.94 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  38 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  33.89 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  51.89 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  43.1 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  38.57 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  42.62 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.19 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  35.9 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  39.5 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  37.17 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  33.85 
 
 		 264 aa  89.7  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  28.92 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  43.2 
 
 		 712 aa  89.4  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.46 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 285 aa  89  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 		 246 aa  89  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.44 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  37.13 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>