More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3109 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 277 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  58.21 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  58.82 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  57.56 
 
 		 348 aa  277  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  54.74 
 
 		 339 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  51.31 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  49.28 
 
 		 292 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  48.54 
 
 		 292 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  52.22 
 
 		 441 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  51.09 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  51.09 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  51.09 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  50.56 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  49.63 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  50.92 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  48.7 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  46.76 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.81 
 
 		 368 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  46.82 
 
 		 311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  47.94 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  52.03 
 
 		 484 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  43.82 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  47.73 
 
 		 287 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  43.91 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  44.91 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  43.11 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  46.93 
 
 		 352 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.93 
 
 		 403 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 280 aa  175  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  39.21 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  40.52 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  40.22 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  38.72 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  55.33 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  32.39 
 
 		 343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.72 
 
 		 328 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 		 475 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  44.62 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  37.7 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  39.58 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  35.68 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.15 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  37.81 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  33.16 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  48.7 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 		 287 aa  99  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  48.67 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.07 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  38.97 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.2 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  44.03 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  44.03 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  46.15 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  42.34 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  44.17 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.15 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.81 
 
 		 261 aa  95.5  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 		 262 aa  95.5  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  46.04 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>