More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1784 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
286 aa  560  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  68.38 
 
 
275 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1045  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 
276 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.447083  normal  0.0440857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  35.59 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  46.78 
 
 
266 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  37.77 
 
 
261 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  36.39 
 
 
282 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.63 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  36.91 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  36.91 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  36.91 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  35.74 
 
 
261 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  35.97 
 
 
259 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.27 
 
 
285 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 
264 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  29.54 
 
 
271 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  46.75 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  35.5 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  34.96 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  36.69 
 
 
279 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  35.5 
 
 
285 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  37.72 
 
 
267 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  37.72 
 
 
264 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  37.13 
 
 
285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  40.19 
 
 
271 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.13 
 
 
285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.13 
 
 
285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  37.13 
 
 
285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  37.13 
 
 
285 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  36.63 
 
 
285 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.63 
 
 
285 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  36.63 
 
 
285 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  36.63 
 
 
285 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  36.63 
 
 
285 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  36.63 
 
 
285 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  36.63 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.45 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  36.63 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  36.63 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  39.08 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  35.52 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  37.36 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  44.16 
 
 
268 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  48 
 
 
264 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 
270 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  32.29 
 
 
287 aa  112  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  31.68 
 
 
290 aa  112  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  31.99 
 
 
280 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
211 aa  112  6e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
252 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  48.41 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  47.29 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  47.5 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  31.41 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  36.82 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  37.95 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  46.38 
 
 
285 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
285 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  31.4 
 
 
289 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  37.43 
 
 
284 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
281 aa  109  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.41 
 
 
475 aa  109  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  38.95 
 
 
261 aa  109  6e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  50.85 
 
 
264 aa  109  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  34.65 
 
 
282 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.85 
 
 
236 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  45.83 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 
269 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  41.21 
 
 
260 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 
260 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
242 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  40.7 
 
 
260 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
265 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
263 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
263 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 
271 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
295 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
295 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  40.7 
 
 
260 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
263 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>