More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1184 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
302 aa  568  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  60.28 
 
 
289 aa  325  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  58.02 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  56.36 
 
 
403 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  59.03 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  47.64 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
339 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  48.3 
 
 
287 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
313 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
348 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 
276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
292 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
296 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.77 
 
 
368 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  43.6 
 
 
293 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 
284 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 
284 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  42.47 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  43 
 
 
308 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 
284 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  44.33 
 
 
281 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 
322 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  40.27 
 
 
306 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 
311 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  42.12 
 
 
281 aa  185  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  45.1 
 
 
441 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  43.6 
 
 
308 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  43.26 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  44.52 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  45.1 
 
 
484 aa  168  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  37.21 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  41.2 
 
 
291 aa  158  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  39.24 
 
 
278 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 
343 aa  139  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  33.33 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  49.64 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  37.43 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  35.08 
 
 
275 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  30.68 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  33.15 
 
 
260 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  39.58 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.88 
 
 
272 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 
281 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  44.88 
 
 
268 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  30.83 
 
 
261 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
265 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 
342 aa  107  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
341 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
267 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
268 aa  105  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  30.51 
 
 
258 aa  104  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  37.44 
 
 
281 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  31.47 
 
 
259 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
252 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  34.56 
 
 
293 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
310 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  36.08 
 
 
267 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  33.17 
 
 
285 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
280 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  31.78 
 
 
285 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 
284 aa  102  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  39.86 
 
 
351 aa  101  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
271 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
296 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  36.08 
 
 
267 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  34.4 
 
 
282 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  42.04 
 
 
254 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  34.31 
 
 
274 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  32.7 
 
 
285 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  36.08 
 
 
267 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
285 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
285 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
277 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1500  phosphatidate cytidylyltransferase  28.62 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  42.55 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  36.16 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  35.29 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  31.75 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  37.5 
 
 
282 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  37.5 
 
 
282 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  37.5 
 
 
282 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 
279 aa  99  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  38.04 
 
 
279 aa  99  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
475 aa  98.2  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  40.91 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  42.44 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.08 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  30.27 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  48.41 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
269 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>