More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1596 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 271 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  99.63 
 
 		 271 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  93.36 
 
 		 271 aa  477  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  97.42 
 
 		 271 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  79.7 
 
 		 271 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  79.32 
 
 		 268 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  77.86 
 
 		 271 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  74.35 
 
 		 271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  74.35 
 
 		 271 aa  341  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  74.54 
 
 		 271 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  68.27 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  51.85 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  51.28 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 		 285 aa  208  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.74 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  46.48 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  48.56 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  47.87 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  47.87 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  47.87 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  41.99 
 
 		 287 aa  204  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  46.07 
 
 		 285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.64 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.64 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.64 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.64 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.64 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  44.64 
 
 		 285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.29 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  43.93 
 
 		 285 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  44.29 
 
 		 285 aa  194  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  44.79 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.65 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 		 280 aa  188  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  40.86 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  40.99 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  41.7 
 
 		 285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  41.87 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  44.86 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  40.71 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  42.81 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  41.37 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  41.45 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  41.87 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 		 268 aa  158  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  41.34 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  41.32 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  41.52 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  38.63 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  41.58 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  38.72 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  39.76 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  44.6 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  42.66 
 
 		 284 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  36.27 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  37.31 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0325  phosphatidate cytidylyltransferase  35.56 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  39.49 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  43.01 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  41.82 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1461  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.152404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2450  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  41.37 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1687  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.73 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426329  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  39.57 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  39.58 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  41.64 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>