More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0325 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0325  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
284 aa  554  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  99.3 
 
 
284 aa  551  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  65.61 
 
 
278 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  66.31 
 
 
270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  39.86 
 
 
285 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  39.86 
 
 
285 aa  175  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
285 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  39.86 
 
 
285 aa  175  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  39.86 
 
 
285 aa  175  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  39.86 
 
 
285 aa  175  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  39.86 
 
 
285 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  36.97 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  39.86 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  36.64 
 
 
280 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  39.01 
 
 
282 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  39.01 
 
 
282 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  39.01 
 
 
282 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  35.92 
 
 
271 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  39.15 
 
 
285 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.43 
 
 
285 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  38.79 
 
 
285 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.79 
 
 
285 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.79 
 
 
285 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  38.79 
 
 
285 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  38.79 
 
 
285 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  36.27 
 
 
268 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  36.27 
 
 
272 aa  168  8e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  38.03 
 
 
282 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  36.71 
 
 
280 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
285 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  38.04 
 
 
271 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  44.95 
 
 
249 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  38.08 
 
 
285 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  37.54 
 
 
281 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  38.08 
 
 
285 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  36.01 
 
 
285 aa  158  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  37.19 
 
 
268 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  38.72 
 
 
256 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
285 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  36.96 
 
 
271 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 
285 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  38.08 
 
 
283 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  37.19 
 
 
285 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  37.19 
 
 
285 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  37.93 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  36.08 
 
 
287 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  36.49 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  34.27 
 
 
285 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  55.3 
 
 
275 aa  150  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
274 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  36.75 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  37.54 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  38.83 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  35.92 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 
271 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  57.25 
 
 
269 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  36.79 
 
 
271 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  35.79 
 
 
285 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  36.24 
 
 
271 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  55.12 
 
 
269 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  35.46 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  38.25 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  35.94 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  32.75 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.43 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  36.96 
 
 
271 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 
261 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  36.21 
 
 
279 aa  138  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 
271 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  38.98 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1461  phosphatidate cytidylyltransferase  39.58 
 
 
274 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.152404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  37.54 
 
 
328 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  34.51 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  34.33 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  52.85 
 
 
268 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
263 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  35.25 
 
 
280 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  39.11 
 
 
279 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
263 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  51.9 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  31.54 
 
 
265 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.36 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 
264 aa  119  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.4 
 
 
264 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  50.39 
 
 
264 aa  118  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.4 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  35.94 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  49.22 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  48.36 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  48.36 
 
 
263 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  49.17 
 
 
265 aa  116  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>