More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2690 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
282 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  80.85 
 
 
276 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  69.86 
 
 
284 aa  362  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  69.86 
 
 
281 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  70.21 
 
 
284 aa  338  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  67.38 
 
 
281 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4943  phosphatidate cytidylyltransferase  68.44 
 
 
284 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1828  phosphatidate cytidylyltransferase  69.15 
 
 
284 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1443  phosphatidate cytidylyltransferase  63.48 
 
 
283 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  56.54 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2845  phosphatidate cytidylyltransferase  55.56 
 
 
278 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  46.95 
 
 
273 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  47.31 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  45.42 
 
 
273 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6063  phosphatidate cytidylyltransferase  46.24 
 
 
273 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  46.59 
 
 
273 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  46.24 
 
 
273 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  44.29 
 
 
272 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1262  phosphatidate cytidylyltransferase  45.2 
 
 
273 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1687  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426329  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  48.03 
 
 
273 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2450  phosphatidate cytidylyltransferase  46.07 
 
 
273 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  43.01 
 
 
273 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  43.01 
 
 
272 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
275 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2578  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2488  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2432  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0787111  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1550  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 
273 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3260  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 
273 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0696258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1323  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 
273 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.077571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2051  phosphatidate cytidylyltransferase  49.1 
 
 
273 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  41.49 
 
 
271 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  42.35 
 
 
273 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.31 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  44.17 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  39.59 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  40.56 
 
 
271 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  40.99 
 
 
268 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  40.36 
 
 
267 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 
273 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  41.43 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  32.34 
 
 
287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  39.37 
 
 
271 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  35.81 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  37.41 
 
 
285 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  38.68 
 
 
274 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  41.81 
 
 
271 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  42.36 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  37.54 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  41.78 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  35.02 
 
 
282 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  35.02 
 
 
282 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  35.02 
 
 
282 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  37.54 
 
 
285 aa  126  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.23 
 
 
285 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.12 
 
 
285 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
287 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  38.01 
 
 
267 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  36.82 
 
 
285 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  38.23 
 
 
285 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0662  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  35.92 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  31.1 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  37.72 
 
 
271 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  31.89 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  31.03 
 
 
284 aa  113  3e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  41.89 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  38.68 
 
 
268 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  34.51 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  32.2 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  34.27 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  32.25 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  34.27 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 
287 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  36.93 
 
 
328 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  37.54 
 
 
275 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  37.54 
 
 
273 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
283 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  34.22 
 
 
285 aa  105  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 
273 aa  105  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 
280 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  29.27 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  33.89 
 
 
285 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>