More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1165 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
271 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
271 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  38.13 
 
 
271 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  35.77 
 
 
265 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  37.09 
 
 
265 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 
268 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  36.2 
 
 
271 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  37.59 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  37.59 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  37.59 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  37.1 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.62 
 
 
285 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  39.15 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  36.79 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 
285 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  34.48 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  36.11 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  39.35 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  39.35 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  35.84 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  39.35 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  35.84 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  35.84 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  35.84 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  35.84 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  33.93 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  35.93 
 
 
272 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  35.93 
 
 
268 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.19 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  35.56 
 
 
282 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  34.39 
 
 
285 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  33.93 
 
 
285 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.93 
 
 
285 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  33.93 
 
 
285 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  33.93 
 
 
285 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  33.93 
 
 
285 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  33.93 
 
 
285 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  33.93 
 
 
285 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  34.74 
 
 
287 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
271 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 
285 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  34.69 
 
 
280 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  32.37 
 
 
284 aa  122  8e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 
287 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 
271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  34.71 
 
 
285 aa  119  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  35.03 
 
 
285 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 
285 aa  118  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  33.56 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  36.18 
 
 
249 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
285 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  47.22 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  46.04 
 
 
268 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 
287 aa  115  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  35.69 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  35.63 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  34.69 
 
 
285 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  32.55 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  32.53 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  31.72 
 
 
256 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  31.73 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  36.63 
 
 
271 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  35.23 
 
 
272 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  36 
 
 
271 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
267 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  34.33 
 
 
290 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  34.56 
 
 
285 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
242 aa  106  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.03 
 
 
272 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
284 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  36.63 
 
 
254 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  51.28 
 
 
278 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  32.21 
 
 
261 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  29.1 
 
 
260 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  29.1 
 
 
260 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.57 
 
 
368 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 
269 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  29.15 
 
 
247 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  32.2 
 
 
276 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 
279 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 
276 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  33.93 
 
 
273 aa  102  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 
269 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
241 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
296 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  29.49 
 
 
279 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  30.85 
 
 
281 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  35.11 
 
 
279 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
328 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.41 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  47.46 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  41.83 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
287 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>