More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1687 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1687  putative phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 273 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426329  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2450  phosphatidate cytidylyltransferase  95.97 
 
 		 273 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  83.09 
 
 		 273 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  75.09 
 
 		 273 aa  361  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  74.73 
 
 		 273 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6063  phosphatidate cytidylyltransferase  74.36 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  74.36 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  77.66 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  71.43 
 
 		 273 aa  344  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  71.79 
 
 		 273 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1262  phosphatidate cytidylyltransferase  74.36 
 
 		 273 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2051  phosphatidate cytidylyltransferase  78.02 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1550  phosphatidate cytidylyltransferase  78.02 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1323  phosphatidate cytidylyltransferase  78.02 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.077571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3260  phosphatidate cytidylyltransferase  78.02 
 
 		 273 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0696258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2488  phosphatidate cytidylyltransferase  77.66 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2578  phosphatidate cytidylyltransferase  77.66 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2432  phosphatidate cytidylyltransferase  77.66 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0787111  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  50.73 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  49.81 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  49.64 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  48.01 
 
 		 275 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  47.08 
 
 		 275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  47.99 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  46.5 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  46.07 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  49.62 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  46.79 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  44.24 
 
 		 281 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  41.84 
 
 		 276 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  47.65 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  44.57 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  44.2 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2845  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 		 278 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  43.66 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1828  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4943  phosphatidate cytidylyltransferase  47.39 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  42.49 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  37.01 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1443  phosphatidate cytidylyltransferase  43.4 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  41.2 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  42.39 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  39.79 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  38.78 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  38.35 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  38.35 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  36.05 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  36.08 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  36.08 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  36.08 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  36.21 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  35.93 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  37.76 
 
 		 285 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  51.54 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  35 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  33.88 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  35.96 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  34.69 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  33.88 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  35.4 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.4 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  35.4 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  35.4 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  35.4 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  35.4 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  34.58 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  35.05 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  36.64 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  35.4 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.64 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  37.37 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  36.64 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.64 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  36.64 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  46.99 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  47.17 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  36.63 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  51.06 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>