More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2845 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2845  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 278 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  68.59 
 
 		 279 aa  298  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  57.71 
 
 		 281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  57.71 
 
 		 284 aa  262  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  58.06 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  55.56 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  55.91 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4943  phosphatidate cytidylyltransferase  55.2 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  55.71 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1828  phosphatidate cytidylyltransferase  56.43 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1443  phosphatidate cytidylyltransferase  50.71 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  43.53 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  43.93 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  42.03 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6063  phosphatidate cytidylyltransferase  43.93 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.93 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 273 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1262  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1687  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426329  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  38.83 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2450  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  42.26 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  38.6 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  40.5 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  37.84 
 
 		 268 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  40.43 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  39.5 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  39.64 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  44.64 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2578  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2488  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2432  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0787111  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1550  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2051  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3260  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0696258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1323  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 273 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.077571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  39.51 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  42.54 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  36.49 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  35.49 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  36.82 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  38.6 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  35.18 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  40.51 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  31.21 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  33.11 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  37.63 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0662  phosphatidate cytidylyltransferase  36.01 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  34 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  34 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.93 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  34 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  37.37 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  33.87 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  34.01 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  33.12 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  33.87 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.87 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  33.87 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  33.87 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  33.87 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  33.87 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  37.89 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  45.1 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  34.62 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  33.87 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.13 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  41.37 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  30.24 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  34.08 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  34.08 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  34.08 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  34.08 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  34.08 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  34.86 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  37.94 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  31.05 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  32.5 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  41.83 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  36.1 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1461  phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.152404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  36.69 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  31.86 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  36.23 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  31.94 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>