More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1916 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 273 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  98.9 
 
 		 273 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  93.41 
 
 		 273 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  93.04 
 
 		 273 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6063  phosphatidate cytidylyltransferase  92.67 
 
 		 273 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  92.67 
 
 		 273 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1262  phosphatidate cytidylyltransferase  87.55 
 
 		 273 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  78.75 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  74.26 
 
 		 273 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2450  phosphatidate cytidylyltransferase  72.16 
 
 		 273 aa  323  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1687  putative phosphatidate cytidylyltransferase  71.43 
 
 		 273 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426329  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2578  phosphatidate cytidylyltransferase  78.75 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2432  phosphatidate cytidylyltransferase  78.75 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0787111  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2488  phosphatidate cytidylyltransferase  78.75 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1550  phosphatidate cytidylyltransferase  78.75 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2051  phosphatidate cytidylyltransferase  78.75 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3260  phosphatidate cytidylyltransferase  78.75 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0696258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1323  phosphatidate cytidylyltransferase  78.75 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.077571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  53.48 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  50.18 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  51.15 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  49.64 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  46.79 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  51.15 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  48.04 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  48.08 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  43.88 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  47.5 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 284 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  47.86 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  42.81 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1828  phosphatidate cytidylyltransferase  45.91 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.09 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  42.09 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  38.3 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  40.79 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1443  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 283 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4943  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  39.58 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  41.9 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  39.64 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  39.57 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  33 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.05 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  37.98 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  42.35 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  38.91 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  36.04 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  36.04 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  39.78 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.57 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  35.45 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  48.67 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  32.99 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  35.23 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  37.64 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  33.68 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  32.65 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  32.65 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  33 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  33.56 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  32.73 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  32.65 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  33.56 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  35.23 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  44.89 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  33.56 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  37.18 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  35.17 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0662  phosphatidate cytidylyltransferase  35.4 
 
 		 270 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 		 328 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  30.45 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  38.29 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0325  phosphatidate cytidylyltransferase  34.48 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  33.56 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  43.92 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  30.69 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  34.62 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  33.67 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>