More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10160 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  100 
 
 		 301 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  46.74 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  46.74 
 
 		 289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  48.43 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  46.1 
 
 		 348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  47.87 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 		 284 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  47.32 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  46.52 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  44.17 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  45.71 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  42.72 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  39.02 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.35 
 
 		 403 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  47.04 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  43.77 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  39.17 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  39.55 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  40.93 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  42.61 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  37.63 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  37.92 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  36.45 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  32.42 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  31.09 
 
 		 275 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  53.78 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  39.73 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 		 242 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  30.82 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  42.44 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  42.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  42.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  48.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  42.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  42.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  42.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  41.86 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  42.44 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  40.7 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  40.51 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.9 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  30.56 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.9 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.9 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.9 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.9 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  46.09 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  44.83 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  35.46 
 
 		 282 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  49.15 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  44.96 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  48.25 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  46.04 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  38.67 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 		 261 aa  99.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  38.67 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.67 
 
 		 475 aa  99.4  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  35.68 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  29.18 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  38.29 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 		 267 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  30.96 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>