More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1675 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  63.73 
 
 
297 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  58.5 
 
 
292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  58.84 
 
 
292 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  54.28 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  59.01 
 
 
284 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  59.01 
 
 
284 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  59.01 
 
 
284 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  53.95 
 
 
293 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  51.59 
 
 
281 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  47.84 
 
 
287 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  46 
 
 
348 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  46.89 
 
 
441 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  48.92 
 
 
277 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 
339 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
276 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  42.03 
 
 
284 aa  205  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  43.96 
 
 
289 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  46.26 
 
 
281 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  44.04 
 
 
313 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  42.05 
 
 
308 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  41.91 
 
 
301 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.59 
 
 
368 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 
280 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  45.89 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  38.54 
 
 
308 aa  182  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 
302 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
484 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  42.05 
 
 
290 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  37.41 
 
 
311 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  40.42 
 
 
306 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.89 
 
 
403 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  36.39 
 
 
322 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
352 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  36.2 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.66 
 
 
328 aa  129  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
343 aa  122  8e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  32.71 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 
475 aa  109  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  52.27 
 
 
291 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 
277 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  35.16 
 
 
284 aa  105  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 
287 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  45.19 
 
 
282 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  43.38 
 
 
282 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  45.19 
 
 
282 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  45.19 
 
 
282 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  36.76 
 
 
296 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 
285 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  47.58 
 
 
282 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  28.28 
 
 
303 aa  103  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 
269 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  48.06 
 
 
249 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  48.06 
 
 
285 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.06 
 
 
285 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  48.06 
 
 
285 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  48.06 
 
 
285 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  48.06 
 
 
285 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  48.06 
 
 
285 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  48.06 
 
 
285 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  48.06 
 
 
285 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  47.66 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  47.66 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.66 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  47.66 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  38.41 
 
 
279 aa  99.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.66 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  40.12 
 
 
285 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
280 aa  99  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  42.25 
 
 
273 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  28.91 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.25 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  40.98 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  28.91 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  34.19 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  36.97 
 
 
260 aa  96.3  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 
278 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 
254 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 
285 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  32.02 
 
 
264 aa  95.5  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  37.09 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  31.2 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  40.56 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
273 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 
285 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  47.71 
 
 
281 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>