More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2751 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
255 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  95.69 
 
 
255 aa  371  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  60.7 
 
 
233 aa  271  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  55.34 
 
 
258 aa  258  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3728  phosphatidate cytidylyltransferase  64.1 
 
 
248 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  50.6 
 
 
252 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1255  phosphatidate cytidylyltransferase  60.89 
 
 
262 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00219294  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
236 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  44.51 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
279 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 
274 aa  141  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  42.13 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
281 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.11 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40.34 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  42.93 
 
 
296 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.43 
 
 
281 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  40.08 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
242 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 
280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  34.32 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  34.32 
 
 
264 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 
275 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  38.86 
 
 
282 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  36.13 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  37.71 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  43.87 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 
263 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 
263 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  36.93 
 
 
263 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  36.93 
 
 
263 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.81 
 
 
279 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  36.93 
 
 
263 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  36.93 
 
 
265 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.81 
 
 
282 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.81 
 
 
275 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  35.04 
 
 
259 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  40.66 
 
 
280 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
296 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  34.58 
 
 
307 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  37.64 
 
 
281 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  45.75 
 
 
254 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  41.25 
 
 
278 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  38.05 
 
 
286 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  45.57 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  41.78 
 
 
246 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
277 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.25 
 
 
266 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
268 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  35.84 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  37.85 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  34.44 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
284 aa  116  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  45.65 
 
 
254 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.91 
 
 
272 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
264 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
285 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  49.67 
 
 
270 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  35.81 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  47.58 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  38.69 
 
 
280 aa  115  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
285 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  39.8 
 
 
277 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
258 aa  115  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  35.83 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  44.5 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 
261 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  32.66 
 
 
269 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.16 
 
 
265 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 
284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  29.43 
 
 
306 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  47.24 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1424  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.521758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
285 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 
295 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  48.72 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  42.66 
 
 
265 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  42.66 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  33.85 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  36.41 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  42.86 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
290 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>