More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2381 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  48.11 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 
266 aa  195  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  47.21 
 
 
269 aa  191  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  48.47 
 
 
268 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  41.7 
 
 
272 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  32.36 
 
 
296 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.39 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.3 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  52.94 
 
 
280 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  49.21 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  51.38 
 
 
282 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 
261 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39 
 
 
260 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39 
 
 
260 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  45.21 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.01 
 
 
263 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
242 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  29.84 
 
 
264 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  29.84 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
262 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  51.72 
 
 
282 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  44.8 
 
 
264 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37 
 
 
260 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  32 
 
 
278 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  39.39 
 
 
265 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  30.98 
 
 
261 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
254 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  37.97 
 
 
263 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 
252 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
263 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
263 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
263 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
265 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
263 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
263 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
263 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
271 aa  105  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
208 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.6 
 
 
236 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  33.86 
 
 
267 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
255 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
267 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  30.3 
 
 
307 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
286 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 
233 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  40.78 
 
 
285 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  45.08 
 
 
216 aa  102  7e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 
285 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  39.11 
 
 
273 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
282 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
277 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
272 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
268 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  33.07 
 
 
267 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  47.83 
 
 
205 aa  100  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
280 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
264 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  47.86 
 
 
260 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  34.26 
 
 
259 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
268 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 
211 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 
368 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  43.88 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  43.88 
 
 
286 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
271 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  38.78 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
254 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 
276 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  36.78 
 
 
270 aa  99  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  48.62 
 
 
289 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  42.04 
 
 
280 aa  99  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  47.5 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  51.38 
 
 
282 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  37.29 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  39.68 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  47.9 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  48.18 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  40.45 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  39.46 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  50.39 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  47.57 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  40.11 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>