More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0362 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
284 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  71.79 
 
 
273 aa  368  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  67.4 
 
 
273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  66.91 
 
 
271 aa  311  9e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  63.6 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  53.76 
 
 
277 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  52.83 
 
 
281 aa  265  7e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  33.92 
 
 
282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  35.56 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
281 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  36.13 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.72 
 
 
281 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  36.27 
 
 
277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
263 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  32.44 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  26.8 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  30.72 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  28.76 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  33.82 
 
 
263 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  33.82 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
282 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  33.82 
 
 
263 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  32.1 
 
 
277 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  33.82 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.13 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  39.88 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  33.74 
 
 
265 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  40.33 
 
 
285 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  34.04 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  34.04 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  34.04 
 
 
282 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  30.61 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  45.16 
 
 
233 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  40.33 
 
 
285 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 
285 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
285 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  32.13 
 
 
269 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 
280 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  41.25 
 
 
284 aa  104  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 
254 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 
293 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  33.05 
 
 
280 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 
271 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  30.74 
 
 
712 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  41.03 
 
 
282 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 
265 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
295 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 
271 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
271 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
295 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 
282 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
284 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  38.69 
 
 
242 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  37.82 
 
 
252 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  40.38 
 
 
285 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
284 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  28.52 
 
 
264 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.23 
 
 
264 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 
280 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  28.1 
 
 
271 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
261 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  44.7 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
246 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  35.89 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 
281 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  39.87 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
290 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  39.1 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  38.96 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  27.62 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  39.1 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  35.47 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  49.58 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  40.5 
 
 
298 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  42.41 
 
 
262 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>