More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3191 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
287 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
268 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  41.7 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  43.43 
 
 
285 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  40.49 
 
 
286 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  39.65 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  55.26 
 
 
270 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  39.23 
 
 
280 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
282 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.7 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  35.41 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  37.16 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 
270 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  42.34 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  39.57 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
282 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  40.55 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  39.38 
 
 
282 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  39.38 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  40.87 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 
272 aa  125  9e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  40.08 
 
 
300 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
281 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  44.93 
 
 
216 aa  123  4e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  45.59 
 
 
208 aa  122  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  38.6 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  52.24 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 
294 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  33.55 
 
 
273 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  34.07 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  48.7 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
273 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  53.28 
 
 
264 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 
271 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
273 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  46.63 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  51.52 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  31.84 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  51.24 
 
 
264 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  37.45 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  35.39 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  34.38 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  31.4 
 
 
253 aa  110  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  38.79 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  31.94 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 
307 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  40.88 
 
 
284 aa  108  1e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  45.45 
 
 
264 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  47.46 
 
 
285 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  47.46 
 
 
285 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  36.5 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.46 
 
 
285 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  31.75 
 
 
280 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  54.55 
 
 
262 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  41.51 
 
 
241 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  47.46 
 
 
285 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  47.46 
 
 
285 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  36.97 
 
 
254 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 
271 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  46.61 
 
 
285 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 
285 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  47.58 
 
 
264 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 
280 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  57.01 
 
 
278 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  48.8 
 
 
263 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  49.57 
 
 
265 aa  105  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
280 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  50.85 
 
 
279 aa  105  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  46.61 
 
 
285 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.61 
 
 
285 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
261 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  37.09 
 
 
281 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
241 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  46.61 
 
 
285 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  46.61 
 
 
249 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  42.67 
 
 
241 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  53.21 
 
 
263 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  46.61 
 
 
285 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  46.61 
 
 
285 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  46.61 
 
 
285 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  46.61 
 
 
285 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  31.02 
 
 
285 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.73 
 
 
281 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 
273 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
285 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>