More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2044 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
286 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  88.81 
 
 
286 aa  447  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  87.76 
 
 
286 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  60.67 
 
 
285 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  51.91 
 
 
281 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  51.57 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  41.42 
 
 
282 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  41.82 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
280 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  44.16 
 
 
270 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  38.73 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.63 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  38.65 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  40.78 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  37.78 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  41.47 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
270 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  38.43 
 
 
272 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
270 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  53.38 
 
 
229 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  50.34 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  39.08 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
270 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
268 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  45.83 
 
 
216 aa  105  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
267 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.92 
 
 
265 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  47.1 
 
 
287 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 
261 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
263 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 
260 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  30.27 
 
 
269 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  45.76 
 
 
264 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
270 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  45.06 
 
 
242 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
263 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  46.47 
 
 
285 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  36.41 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  44.79 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 
270 aa  99.4  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  44.81 
 
 
273 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  44.81 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  42.19 
 
 
263 aa  98.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
211 aa  98.6  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
221 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  45.13 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
205 aa  97.1  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  53.57 
 
 
263 aa  96.3  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  44.7 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  44.7 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  44.7 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  50.91 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  50.44 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
208 aa  95.5  9e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
273 aa  95.5  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  43.12 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  34.56 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  32.86 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
263 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  35.92 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.97 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  43.31 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  32.51 
 
 
285 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  46.02 
 
 
252 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
263 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
263 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
263 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  47.5 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 
284 aa  93.6  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  43.94 
 
 
282 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
275 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  44.16 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>