More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1386 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
285 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  48.21 
 
 
277 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  50.57 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  49.24 
 
 
276 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  46.39 
 
 
280 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  49.63 
 
 
278 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  49.63 
 
 
270 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  50.75 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  42.38 
 
 
272 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  41.11 
 
 
282 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  44.31 
 
 
268 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  43.43 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  38.78 
 
 
296 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  43.27 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  42.53 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
282 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  41.25 
 
 
268 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 
286 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
289 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  60.14 
 
 
229 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 
286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  40.86 
 
 
281 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 
294 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 
273 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  38.32 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 
273 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 
273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  41.92 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  34.87 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  40.61 
 
 
280 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  36.94 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  49.23 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
280 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
211 aa  118  9e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  47.24 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  38.51 
 
 
216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  31.73 
 
 
264 aa  116  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
274 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  32.97 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  50.82 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  34.46 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  44.1 
 
 
288 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 
267 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 
263 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
261 aa  112  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 
280 aa  112  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.2 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  37.64 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  46.81 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  31.52 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  43.71 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  53.1 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 
271 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.18 
 
 
205 aa  109  5e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  32.79 
 
 
260 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  41.83 
 
 
281 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  32.79 
 
 
260 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  28.74 
 
 
208 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  44.29 
 
 
287 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  51.64 
 
 
280 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 
341 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  36.96 
 
 
271 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
275 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  38.92 
 
 
263 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
263 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  34.13 
 
 
264 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
268 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
280 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  44.12 
 
 
284 aa  106  4e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
270 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  49.3 
 
 
271 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  36.95 
 
 
294 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  45.31 
 
 
285 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  50.39 
 
 
271 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  52.03 
 
 
271 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  32 
 
 
264 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 
265 aa  105  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
279 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  32.68 
 
 
280 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  48.91 
 
 
287 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.67 
 
 
277 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  50.47 
 
 
266 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 
276 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  34.63 
 
 
275 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
285 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  36.32 
 
 
267 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  43.65 
 
 
285 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>