More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2441 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
282 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  68.44 
 
 
282 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  65.96 
 
 
282 aa  341  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  63.83 
 
 
282 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  64.89 
 
 
280 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  64.18 
 
 
280 aa  285  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  61.21 
 
 
289 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  38.29 
 
 
280 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 
296 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 
270 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 
294 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  36 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
276 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  41.82 
 
 
285 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  39.24 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 
270 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
286 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 
273 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 
273 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  40 
 
 
264 aa  122  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  44.2 
 
 
264 aa  122  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  38.4 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  35.38 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  43.43 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
273 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  39.02 
 
 
262 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  57.41 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  45.51 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  37.36 
 
 
264 aa  116  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
260 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
260 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  52.59 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
260 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  36.11 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 
261 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  48.92 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  37.64 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  43.21 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  31.85 
 
 
296 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.09 
 
 
264 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 
266 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  54.31 
 
 
264 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
256 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  50.91 
 
 
268 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
284 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  39.62 
 
 
280 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
280 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  33.85 
 
 
277 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  48.39 
 
 
287 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  42.18 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  42.86 
 
 
263 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  48.34 
 
 
229 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 
271 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
254 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  33.6 
 
 
263 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  35.94 
 
 
211 aa  106  5e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 
268 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
285 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  42.86 
 
 
265 aa  105  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 
285 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  47.97 
 
 
242 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 
266 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  36.49 
 
 
281 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  42.36 
 
 
285 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 
283 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  34.13 
 
 
263 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 
267 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
273 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.93 
 
 
264 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
267 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  33.73 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  33.73 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  30.48 
 
 
270 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  35.36 
 
 
280 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.13 
 
 
267 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  42.55 
 
 
285 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  33.73 
 
 
263 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  26.97 
 
 
269 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
265 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  32.94 
 
 
263 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  32.94 
 
 
263 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  32.94 
 
 
263 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  46.04 
 
 
265 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  34.77 
 
 
261 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  36.15 
 
 
265 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  40.49 
 
 
286 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 
272 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
275 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
205 aa  102  9e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
285 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>