More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1374 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1374  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
248 aa  474  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.19741  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  45.37 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  49.04 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  34.81 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  34.1 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  49.3 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  31.16 
 
 
296 aa  108  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  46.46 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  42.41 
 
 
282 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 
276 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  47.95 
 
 
285 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  34.35 
 
 
276 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  42.41 
 
 
289 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  48.57 
 
 
286 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  48.57 
 
 
286 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  32.36 
 
 
273 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  52 
 
 
273 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  45.58 
 
 
272 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  40.65 
 
 
270 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  32.87 
 
 
211 aa  103  3e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  46.43 
 
 
286 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  31.68 
 
 
294 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
264 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
287 aa  102  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  43.71 
 
 
269 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  46.38 
 
 
296 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
273 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
278 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 
229 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
273 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
273 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
273 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
278 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
263 aa  99.4  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  43.05 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  33.18 
 
 
216 aa  99.4  5e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  42.47 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  31.02 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  50.41 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  32.29 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.78 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1262  phosphatidate cytidylyltransferase  48.39 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
275 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
294 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1323  phosphatidate cytidylyltransferase  50.4 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.077571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1550  phosphatidate cytidylyltransferase  50.4 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3260  phosphatidate cytidylyltransferase  50.4 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0696258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2578  phosphatidate cytidylyltransferase  50.4 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2432  phosphatidate cytidylyltransferase  50.4 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0787111  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2051  phosphatidate cytidylyltransferase  50.4 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
282 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2488  phosphatidate cytidylyltransferase  50.4 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 
283 aa  95.5  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
268 aa  95.1  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
272 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  39.68 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 
271 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  43.7 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 
276 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  28.73 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
273 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 
282 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6063  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  45.45 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  37.31 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  39.24 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  36.3 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  39.02 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2450  phosphatidate cytidylyltransferase  47.97 
 
 
273 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 
475 aa  92.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
282 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  44.29 
 
 
280 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  49.19 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  43.08 
 
 
264 aa  92  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  41.98 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
242 aa  92.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 
285 aa  92  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  40.44 
 
 
271 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  35.5 
 
 
265 aa  92  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  36.97 
 
 
267 aa  92  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>