More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1280 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
270 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1500  phosphatidate cytidylyltransferase  54.24 
 
 
285 aa  276  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  50.19 
 
 
270 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  49.05 
 
 
270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  36.15 
 
 
341 aa  126  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 
281 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.99 
 
 
264 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  38.6 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
260 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
260 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  31.72 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
260 aa  112  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  35.05 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  37.65 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  33.72 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  32.98 
 
 
278 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
296 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
280 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  37.65 
 
 
277 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  35.78 
 
 
306 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  47.69 
 
 
269 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  34.52 
 
 
261 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
255 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  37.02 
 
 
264 aa  105  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
263 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
263 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
263 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
263 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
265 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
263 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  44.93 
 
 
263 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
254 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  43.54 
 
 
306 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  47.2 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  39.42 
 
 
252 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  37.65 
 
 
310 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
270 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  47.93 
 
 
275 aa  102  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  42.54 
 
 
285 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  43.65 
 
 
264 aa  102  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  36.47 
 
 
271 aa  102  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 
285 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
254 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  39.19 
 
 
268 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
274 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  38.1 
 
 
263 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
285 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
246 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 
280 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
296 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 
322 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  34.78 
 
 
265 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  40.31 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  41.48 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  42.65 
 
 
256 aa  98.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  44.27 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  37.6 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  46.4 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  35.06 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
368 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  36.69 
 
 
280 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
287 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  40.31 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  37.58 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 
319 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 
267 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  40.83 
 
 
298 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 
233 aa  95.9  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  33.91 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  41.53 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  41.53 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  37.65 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  38.73 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  41.53 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  36.52 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  29.29 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  33.91 
 
 
284 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>