127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  851    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  57.38 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  52.68 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  51.95 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  45.95 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  28.06 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  25.79 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.51 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.87 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  25.16 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  25.61 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  26.8 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  25.48 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.88 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  25.49 
 
 		 439 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  24.58 
 
 		 508 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  25.96 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  26.83 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  25 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  27.61 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24.75 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  29.51 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  25.6 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.76 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5209  putative Mn2+/Fe2+ transporter protein  24.51 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112749  normal  0.693685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  26.8 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  23.82 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  25.92 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  22.26 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1019  permease  24.84 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.340887  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  22.86 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  23.73 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  23.53 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  23.3 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  28.05 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  26.15 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  24.79 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3643  natural resistance-associated macrophage protein  21.74 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  23.3 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  28.69 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  20.15 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  24.38 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  25.25 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  24.38 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  26.05 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  28.67 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  25.12 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  24.65 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  24.9 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1287  transporter  21.76 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  29.57 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  25.61 
 
 		 452 aa  57  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  23.97 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  24.35 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  21.75 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  21.75 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1109  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  25.42 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.293858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  23.55 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  24.17 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  20.71 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1312  manganese transporter NRAMP  25.07 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000976334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  21.88 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  21.88 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  22.33 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  23.98 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1718  transporter protein  27.81 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  26.73 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.32 
 
 		 625 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  25.93 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12891  hypothetical protein  24.29 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12961  Mn2+/Fe2+ transporter  24.31 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.62 
 
 		 442 aa  49.7  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2396  transporter  24.16 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.73 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00590  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.05 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  24.17 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.6 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.64 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  24.17 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  24.17 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0852  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family- like protein  27.95 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  26.57 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3929  hypothetical protein  32.95 
 
 		 142 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  26.43 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  20.85 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2242  natural resistance-associated macrophage protein  26.46 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  33.54 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  25.94 
 
 		 425 aa  46.6  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  27.47 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1194  manganese transporter NRAMP  25.13 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  19.11 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.13 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  28.64 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  23.96 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0999  NRAMP family Mn2+ and Fe2+ transporter  23.39 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.38 
 
 		 627 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  25.44 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  25.44 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>