279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4677 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  100 
 
 		 450 aa  894    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  70.28 
 
 		 448 aa  605  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  65.57 
 
 		 463 aa  562  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  63.33 
 
 		 426 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  60.97 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  57.63 
 
 		 444 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  56.71 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  58.06 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  58.37 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  59.53 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  56.49 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  59.06 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  56.49 
 
 		 451 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  57.75 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  57.51 
 
 		 446 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  54.87 
 
 		 456 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  58.2 
 
 		 450 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  55.58 
 
 		 456 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  57.11 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  55.79 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  54.93 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  55.37 
 
 		 622 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  58.35 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  58.63 
 
 		 448 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  57.28 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  54.63 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  55.2 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  55.32 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  55.1 
 
 		 463 aa  441  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  49.78 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  49.78 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  53.22 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  51.91 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  50.8 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  49.55 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  54.59 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  55.05 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  50.8 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  54.63 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  50.12 
 
 		 442 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  53.33 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  48.86 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  52.28 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  54.19 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  53.65 
 
 		 625 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  49.32 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.55 
 
 		 627 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  51.56 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  54.17 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  52.23 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  47.95 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  51.77 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  46.99 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  47.33 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  46.79 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  46.79 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  46.79 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  47.03 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  46.88 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  45.39 
 
 		 525 aa  363  3e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  46.88 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  48.38 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  44.71 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  44.71 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  44.71 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  44.71 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  44.71 
 
 		 437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  47.76 
 
 		 448 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  43.1 
 
 		 530 aa  347  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.13 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  47.84 
 
 		 449 aa  344  1e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  45.84 
 
 		 532 aa  345  1e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  47.65 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  46.44 
 
 		 446 aa  342  8e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  47.41 
 
 		 435 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  45.56 
 
 		 452 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  47.41 
 
 		 435 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  46.21 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  47.16 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  47.16 
 
 		 435 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  43.22 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  43.02 
 
 		 522 aa  333  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  45.91 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  44.06 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.01 
 
 		 430 aa  322  9.000000000000001e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  46.81 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  43.28 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  41.5 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  39.2 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  44.89 
 
 		 473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  42.08 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  44.85 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  42.33 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  42.33 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  42.33 
 
 		 436 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  46.06 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.98 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  41.58 
 
 		 435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  41.72 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  41.4 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>